Microbiome指的是在特定环境下所有的微生物、微生物的基因组及微生物与微环境互作。目前人类、地球、家居和海洋Microbiome项目越来越热门。其中人类基因组计划(HMP)致力于找出人体几个特定部位的微生物群落(包括:鼻道、口腔、皮肤、肠道内容物和泌尿生殖道)结构,分析这些微生物对人体健康与疾病中所扮演的角色。
HMP研究过程中使用PowerSoil DNA Isolation Kit提取粪便、肠内容物和其它样品的DNA,下一步是提取同类样品的RNA。
PowerMicrobiome™RNA Isolation Kit设计用于简便快速提取粪便、肠内容物、干粪、口腔棉拭子、分泌物等富含PCR抑制因子样本总RNA。IRT技术(Inhibitor Removal Technology®)能完全去除这些样本中含有的PCR抑制物,如未完全消化的植物成分、裂解红细胞的亚铁血红素等。优化珠磨研磨技术确保各种复杂样品得到充分裂解,保证RNA得率。试剂盒含DNase I及相应试剂,可去除可能污染的基因组DNA。最终RNA洗脱浓缩在RNade-Free Water中,可直接用于cDNA synthesis或RT-qPCR等下游实验。
建议粪便或生物固体加样0.25g。粪便采样后尽快-80℃保存,以保护RNA完整性。
若实验要求RNA需要再一步DNase处理,建议使用RTS DNase™Kit(货号:15200-50),一款的室温稳定保存的DNase完全去除基因组DNA。只需20min即可消化掉30μg DNA,无需加热或EDTA干涉,采用特制的树脂能轻易去除DNase酶。使用RTS DNase™Kit处理完以后,RNA仍能保持原有的高质量。
参考文献:
详细网页说明:PowerMicrobiome™ RNA Isolation Kit
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