存档DNA或粗提DNA样品与我们的DNA Clean-Up试剂盒混匀，抑制因子被选择性地从DNA溶液中去除。所有DNA被离心柱的硅胶滤膜吸附，然后被洗脱下来。DNA的回收率会因影响DNA浓度检测的抑制因子含量不同而有差异。最终DNA可直接用于PCR分析或其它下游应用。建议使用Picogreen法或电泳定量检测DNA回收率。
Clean-Up试剂盒的工作原理:
Clean-Up试剂盒处理带杂质核酸，移除影响下游实验的污染物。所有酶促反应如限制酶切、连接、PCR扩增、测序等都需要纯净的DNA和RNA，以获得的结果。
根据你需要去除的物质来选择合适的Clean-Up试剂盒。还不能确定？就是根据杂质的来源，这些干扰物质通常来自上一次的酶促反应或者提取DNA/RNA的原体/环境。我们的Clean-Up试剂盒根据污染物来源可以分成两大类。
我们最快速简便的试剂盒是设计用于去除PCR扩增或酶切等酶促反应产生的蛋白、引物、dNTPs和盐的试剂盒。我们有三款Clean-Up试剂盒可去除这类蛋白、盐类：UltraClean PCR、UltraClean GelSpin 和UltraClean 15。若手上的是DNA溶液，可选择上述任何一款试剂盒。不过，它们之间也有少许区别。UltraClean PCR和UltraClean GelSpin是基于硅胶离心柱的试剂盒。因此它们的有20μg的DNA吸附上限，DNA吸附片段是50kb。主要区别在于吸附的DNA片段大小下限。UltraClean PCR可回收大于60bp的小分子DNA，而UltraClean GelSpin回收下限是100bp。
UltraClean 15试剂盒使用了硅胶悬浮液替代离心柱来吸附DNA。与UltraClean PCR试剂盒一样拥有更广的DNA片段大小吸附限度（60bp-50kb）。因为硅胶悬浮液可以根据需要增减，可随DNA量来任意调整。UltraClean 15的另一个好处是可对DNA小体积洗脱。非常适合既要回收又要浓缩DNA的场合。基于硅胶离心柱的试剂盒至少需要用50μl洗脱液洗脱。
除了回收溶液中的DNA外，UltraClean GelSpin和UltraClean 15试剂盒还提供了回收琼脂糖凝胶DNA的操作说明。因为UltraClean 15用的是硅胶悬浮液，所以它能根据琼脂糖凝胶块大小作出调整。（只要你有足够大的收集管！）UltraClean GelSpin Kit一次只能放入0.2g琼脂糖块，否则容易堵塞离心柱。
但，如果肮脏的DNA/RNA样品不止被蛋白、引物和盐污染呢？那你就需要使出绝招了！我们两款的试剂盒，PowerClean Pro DNA和PowerClean Pro RNA，以及原有的PowerClean DNA Clean-Up Kit。新的PowerClean Pro 试剂盒拥有流水线式的操作步骤，比原来的PowerClean DNA Clean-Up Kit需需要更少的操作步骤，更少机会在纯化过程中丢失样品。只有这三款针对粗提DNA/RNA的试剂盒含有我们的抑制因子去除技术（Inhibitor Removal Technology），完全去除来自植物、土壤、粪便或血液的复杂PCR抑制因子。常见的杂质有：
· 腐植酸（来自土壤、堆肥）
· 多糖（植物、瘤胃未消化内容物、盲肠内容物、粪便、药物）
· 多酚（植物）
· 黑色素（头发、皮肤、眼睛组织
· 胆盐（粪便
· 亚铁血红素、EDTA、活性炭（血液)
若你去除的杂质并未列在上面，不确定PowerClean试剂盒是否合用，请联系技术部。我们也许知道答案。
已经开始乱了？结论是，我们所有的Clean-Up试剂盒都能去除蛋白、引物和盐类。而只有使用了IRT技术的试剂盒能去除环境来源杂质。下面绘制了一个表格，方便查找合适的试剂盒。
| Clean-up Kit | 绑定吸附介质 | 片段范围 | 琼脂糖凝胶 | 溶液 | 吸附上限 | 抑制因子 |
| PowerClean Pro DNA | 硅胶离心柱 | 100 bp – 50 kb | √ | 20 ug | 环境来源的 | |
| UltraClean PCR DNA | 硅胶离心柱 | 60 bp – 50 kb | √ | 20 ug | 盐类、蛋白 | |
| UltraClean GelSpin DNA | 硅胶离心柱 | 100 bp – 50 kb | √ | √ | 20 ug | 盐类、蛋白 |
| UltraClean 15 DNA | 硅胶悬浮液 | 60 bp – 50 kb | √ | √ | scalable | 盐类、蛋白 |
| PowerClean Pro RNA | 硅胶离心柱 | 100 bp – 50 kb | √ | 40 ug | 环境来源的 |